Hipokampus, latinsky morský koník, je pomenovaný pre svoj tvar. Je súčasťou systému, ktorý riadi mnoho telesných funkcií: limbický systém. Tento systém sa nachádza v mediálnom temporálnom laloku mozgu, blízko centra mozgu.
Hipokampus sa podieľa na ukladaní dlhodobej pamäte, ktorá zahŕňa všetky minulé poznatky a skúsenosti. Vedci si nie sú istí, ako presne sa to deje. Zdá sa, že najmä hipokampus hrá hlavnú úlohu v deklaratívnej pamäti, čo je typ pamäte zahŕňajúci veci, ktoré si možno účelovo vybaviť, napríklad fakty alebo udalosti.
Hipokampus nie je zapojený do typov krátkodobej pamäte a procesnej pamäte (pamäť na to, ako robiť motorické akcie, ako je chôdza). Primárne s nimi zaobchádza kôra a mozoček.
Tí, ktorí stratili funkciu alebo odstránili hlavné časti limbického systému, ale stále majú hipokampus, majú iba dlhodobú pamäť a nemôžu zaznamenávať žiadne nové pamäte alebo funkcie.
